Molekuli za polima za mpira wa silikoni ni minyororo-kama miundo inayoundwa na vifungo vya Si-O (silicon-oksijeni), na sehemu yake kuu ni polysiloxane ya molekuli ya juu ya molar. Kwa sababu bondi ya Si-O-Si ndiyo aina yake ya msingi ya dhamana, atomi za silikoni huunganishwa zaidi na vikundi vya methyl, na kiasi kidogo sana cha vikundi visivyojazwa huletwa kwenye minyororo ya kando.
Nguvu za intermolecular ni ndogo, na molekuli zina muundo wa helical. Vikundi vya Methyl vinapangwa nje na vinaweza kuzunguka kwa uhuru, ambayo hufanya mpira wa silicone kuwa na upinzani bora wa joto, insulation ya umeme, utulivu wa kemikali, nk kuliko raba nyingine za kawaida.
Mpira wa kawaida wa silikoni, yaani polydiformaldehyde siloxane, ina usanidi wa molekuli ya helikosi yenye nguvu ndogo za intermolecular, hivyo kuwa na ustahimilivu bora. Wakati huo huo, vikundi vya formaldehyde vinavyoelekeza nje ya helix vinaweza kuzunguka kwa uhuru, ambayo huweka mpira wa silikoni na sifa za kipekee za uso kama vile haidrofobi na kutonata kwa uso-.